乌鲁木齐市妇幼保健院始建于1951年,2013年挂牌成立新疆维吾尔自治区妇幼保健院,是集预防、保健、医疗、科研、教学、培训为一体的三级甲等妇幼保健机构,为妇女儿童提供妇幼健康服务,承担自治区、乌鲁木齐市妇幼健康业务管理和技术支持工作。为国家妇幼保健中心、北京协和医院、北京大学各附属医院、东南大学附属中大医院对口援疆单位。
妇幼保健院目前拥有两处院址,位于乌鲁木齐解放南路344号的妇幼保健院,毗邻二道桥商圈,占地7亩,使用面积4.5万平方米,开放床位400张;会展院区位于乌鲁木齐会展大道3838号,毗邻乌鲁木齐奥林匹克体育中心,占地约78亩,建筑面积62000平方米,是集医疗、保健、教学、科研、预防、康复为一体的公立非营利性三级综合医院,编制床位450张。