昆明市第三人民医院成立于1954年，是西南地区规模最大的传染病专科医院，是 三级甲等传染病专科医院 、 云南省传染病临床医学中心 、 昆明市传染性疾病医疗质量控制中心 ，2023年3月正式授牌成为 国家感染性疾病临床医学研究中心云南省分中心 和 国家传染病临床医学中心精准医疗与转化医学中心 ，2023年6月成为国家传染病医学中心感染性疾病专科联盟的常务理事单位，是昆明市政府举办的以传染性疾病诊治为重点，集医疗、教学、科研、社区卫生服务为一体的大型综合性传染病专科医院。医院是大理大学第六附属医院、昆明医科大学临床教学医院。
医院业务范围辐射全省、周边省份和东南亚国家，随着专业细分及学科交叉的不断深入，医院致力于建设国内一流的综合性传染病医院， 精专科、强综合 是医院的发展战略，科研创新是医院的立足之本，近年来与中科院动物研究所、中科院武汉病毒研究所、华中科技大学-国家纳米药物工程技术研究中心、联影医疗、迈瑞医疗、华大基因等国内顶级的研发机构开展战略合作及产学研用的转化实践，科研成果显著。
医院有国家级重点专科1个，省级重点专科4个和培育项目1个，市级重点专科5个，设有3个昆明市市级研究中心、1个昆明市重点实验室、30个市级诊疗技术中心和4个区级科技创新团队，是中华护理学会传染病专科护士京外培训基地、云南省医学会结核病学分会主委单位、云南省药学会传染性疾病药学专业委员会主委单位、云南省医院协会安宁疗护专业委员会主委单位、昆明市引进国外智力成果示范单位、昆明市 突发公共事件传染病医疗救治中心 ，是省级传染病创伤救治中心。
