学校现有教职工1560人，其中专任教师1268人，高级职称教师616人，硕士以上学位教师占比达94.8%，博士、硕士研究生导师499人;有泰山学者9人、省有突出贡献的中青年专家3人、享受政府特殊津贴人员4人;全国优秀教师1人，省级教学名师10人，省市级专业技术拔尖人才10人，齐鲁卫生与健康杰出青年14人。临床医学学科保持ESI全球排名前1%，构建“345雁阵式”学科发展体系，有省高水平培育学科1个，省中医药等重点学科7个，省级青年创新团队15个，立项建设省级培育科研创新团队18个。现有国家级博士后科研工作站1个，国家级科研平台1个，山东省院士工作站1个，山东省出生缺陷研究与转化协同创新中心等省级科研平台24个，国家级临床重点专科2个，国家级中医药临床重点专科培育项目1个，省级专科区域医疗中心1项，省级临床重点专科26个，省级临床精品特色专科3个，省重点学科5项。2016年以来，获省级、厅级奖励100余项，授权发明专利58项，发表ESI高被引论文44篇。中华医学会行为医学分会、山东省医学行为分会、山东省神经科学学会和山东省医学会法医学分会挂靠学校，主办《中华行为医学与脑科学杂志》《中华诊断学电子杂志》和《济宁医学院学报》。司法鉴定中心被授予“全国公共法律服务工作先进集体”，是山东省法学院校法治人才培训基地、省服务标准化建设示范单位、省法医规范化培训基地，为山东省唯一法医全领域领军机构。
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