陕西中医药大学第二附属医院是国家中医药管理局三级甲等中西医结合医院、第三批全国重点中西医结合医院、国家推拿专业区域诊疗中心（培育）、住院医师规范化培训基地协同单位、陕西省博士后创新基地、陕西省中医药文化建设示范单位、陕西中医药大学第二临床医学院、临床医学一级学科建设单位。医院先后获得 国家卫生部爱婴医院 、 陕西省卫生行业文明示范单位 、 陕西省首批百姓放心医院 、 陕西省卫生系统先进集体 、 陕西省诚信医院 、 咸阳市文明单位标兵 等荣誉称号。

医院由两个院区组成，秦都院区位于咸阳市渭阳西路5号，占地面积44.07亩。西咸院区位于西咸新区沣西新城龙台观路831号，占地300.96亩。两院区共开放床位1800张。

陕西中医药大学第二临床医学院成立于2013年，现有教研室8个，临床教师265人，在校学生2000余名，其中研究生200余名。2014年～2016年连续三年在全国高等医学院校临床技能竞赛中荣获西北西南分区赛二等奖、特等奖，全国总决赛二等奖、一等奖。