厦门医学院附属第二医院（厦门市第二医院）是厦门岛外唯一—所集医疗、教学、科研、急救为一体的三级甲等综合性公立医院。医院占地面积6.6万平方米，总建筑面积为12.1万平方米，环境优美;共设有5大中心（国家高级卒中中心、国家胸痛中厦门市创伤中心、危重孕产妇救治中心、危重新生儿救治中心），39个临床科室、12个医技辅助科室。编制床位1300张，目前实际开放1300张。
医院拥有3.0T医用核磁共振成像设备（MRJ）、128排螺旋CT、医用）子值绀加速器（LA）、光子发电子H算V断层扫描仪（SPECT）、大孔径T模拟定位机、双板DSA、钒徽光、体外冲击波碎石机、全自动生化分析仪、高档超声彩色多普勒诊断仪、各种腔镜、支气管镜、进口血透机、床旁血液净化系统（CRRT）等先进医疗设备，总价值超5亿元.
全院职工1888人，卫生专业技术人员1597人，其中医师575人、，护士879人，博士研究生23人、硕士研究生441人，硕士研究生导师7人，高级专业技术职称35人。教授16人，副教授52人。