我院由原万州区中医院、万州区中西医结合医院于2016年12月整合而成。2020年7月，医院成建制上划市级管理，为市卫生健康委直属事业单位，增加履行重庆三峡医药高等专科学校附属中医院职能，系一所集医疗、教学、科研、预防、康复、保健等为一体的中医医院。2021年，我院成功晋级国家三级中医医院。
医院现由牌楼、北山两个院部组成，占地面积23.76亩，建筑面积3.86万平方米，业务用房3.44万平方米，编制床位780张，实际开放床位703张。拟新建江南院区占地面积52.88亩，总建筑面积15.21万平方米，设置床位800张。
医院现有在岗职工749人，其中卫生技术人员640人，高级职称119人（正高20人，副高99人）、中级职称178人，重庆市名中医1人，重庆市区县医疗卫生学术技术带头人1人，万州区名中医4人，万州区 平湖英才 2人，万州区学术技术带头人4人。
设有21个病区和31个中医特色专科门诊，拥有骨伤、康复、肾病3个国家级中医重点专科，针灸、肛肠等7个市级中医重点专科，正在建设骨伤科学、肾病学两个市级中医药重点学科；有全国名老中医药专家传承工作室1个、市级名老中医药专家传承工作室1个、第三批重庆市中医药专家学术经验继承工作室5个、临床研究所2个（万州区骨伤研究所、万州区中西医结合肾病临床研究所）；有符合GPP标准的制剂室，生产具有批准文号的院内制剂9种。